Mapování rezervoárového výskytu SARS-CoV-2
| Soňa Peková Na Ministerstvo byl podán projekt týkající se covid-19
1) Detailní zmapování epidemiologické situace SARS-CoV-2 ve veterinárním prostředí a možné patogenity viru SARS-CoV-2 pro zvířata v těsném soužití s člověkem (domácí mazlíčci, hospodářská zvířata, vzácná zvířata v zoologických zahradách) – pomocí kvantitativní Real-Time PCR technologie. 2) Pomocí technik kvantitativní NGS (Next Generation Sequencing; molekulární analýza mikrobiomů), detailní zmapování mikrobiálního osídlení horních a dolních cest dýchacích u zvířat v úzkém kontaktu s člověkem přicházejících k veterinárním vyšetření pro akutní nebo chronickou (exacerbovanou) respirační nákazu. 3) Na základě dat sesbíraných v bodech 1) a 2) vývoj a validace nových, aktualizovaných, kvantitativních multiplex-Real- Time PCR testů pro molekulární mikrobiologii ve veterinárním lékařství, které budou pokrývat aktuálně významný rozsah mikrobů (virů, bakterií, hub) relevantních pro respirační nákazy u zvířat.
• Všechny DNA/RNA izoláty vzorků které dorazí jako PROJEKT COVID-19 a budou ihned analyzovány na přítomnost SARS-- CoV-2 a u kterých bude provedeno požadované diagnostické vyšetření podle klinické indikace, budou dále uloženy do -80°C pro následnou NGS analýzu mikrobiomů - toto vyšetření je velmi drahé (jedna NGS analýza mikrobiomu stojí 25 000 Kč) a neumíme ho bohužel sanovat z vlastních prostředků, musíme tedy počkat na grantové fi nance. Samozřejmě, NGS analýzu lze provést kdykoliv ad hoc, pokud bude fi nančně zainteresován klient/ majitel zvířete. • Vhodné vzorky pro molekulárněmikrobiologickou analýzu jsou jakékoliv materiály z místa předpokládané infekce, tedy aspiráty, BAL, sekrety z dýchacích cest, stěry ze sliznic z míst infekce (na suchý stěrový tampon), nekropsie z postižených tkání - odebrané do sterilní zkumavky, žádné kultivační nebo transportní médium, pouze nativně. • Vzorky do laboratoře prosím zasílejte EMS službou České pošty (cca 150 Kč), nebo přes naši kurýrní službu (služba zdarma, stačí objednat na tel. čísle 800 990 810), kolegyně Radka Svačinová Vrbová Vám zašle vše potřebné pro správný transport biologických vzorků. Těším se na další spolupráci s Vámi a nová data, která využijeme pro vylepšení diagnostiky infekčních nemocí u zvířat. Řada agens je totiž nekultivovatelných, nebo obtížně kultivovatelných, a klasické kultivační mikrobiologii uniká, což komplikuje efektivní a cílenou léčbu pacienta. Se srdečným pozdravem a díky za spolupráci! Soňa Peková |
